42 команды (обладатель кубка, чемпионы национальных внутренних лиг и переменное число других клубов из важнейших национальных внутренних лиг) играли в раундах плей-офф дома и на выезде. Победитель определялся по общему счету обеих игр.
Шестнадцать оставшихся после раундов на выбывание команд вошли в групповой этап регулярного сезона, разделенные на две группы по восемь команд, играющих по круговой системе. Окончательное положение основывалось на индивидуальных победах и поражениях. В случае ничьей между двумя или более командами после группового этапа для определения окончательной классификации использовались следующие критерии: 1) количество побед в играх один на один между командами; 2) средний показатель очков между командами; 3) общий средний показатель очков в группе.
Четыре лучшие команды из каждой группы после группового этапа регулярного сезона вышли в четвертьфинал плей-офф (X-пары, лучшая из 3 игр).
Четыре победителя четвертьфинала плей-офф вышли в финальную стадию ( Финал четырёх ), которая прошла в заранее определённом месте.
Распределение команд
Метки в скобках показывают, как каждая команда квалифицировалась на место в своем стартовом раунде:
TH: Обладатель титула
1-й, 2-й, 3-й, 4-й, 5-й и т.д.: позиция в лиге после возможных плей-офф
* Партизан был выбран для участия в соревновании, но не был допущен к участию из-за эмбарго ООН на СР Югославию. ФИБА решила не заменять Партизан другой командой на групповом этапе регулярного сезона, поэтому 15 квалифицированных клубов пришлось распределить неравномерно в этом раунде (группа из 8 команд и еще одна из всего лишь 7).
**Црвена Звезда была выбрана для участия в соревновании, но не была допущена к участию из-за эмбарго ООН на СР Югославию. ПАОК прошел с легкой победой.