1,4-дигидрокси-2-нафтоат полипренилтрансфераза
| 1,4-дигидрокси-2-нафтоат полипренилтрансфераза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 2.5.1.74 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| ИнтЭнз | IntEnz вид | ||||||||
| БРЕНДА | запись BRENDA | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme вид | ||||||||
| КЕГГ | запись KEGG | ||||||||
| МетаЦик | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| |||||||||
1-4-дигидрокси-2-нафтоат (DHNA) полипренилтрансфераза (EC 2.5.1.74) — фермент , катализирующий химическую реакцию: полностью транс-нонапренилдифосфат + 1-4-дигидрокси-2-нафтоат + H+ деметилменахинол -9 + дифосфат + диоксид углерода
Таким образом, 3 субстрата этого фермента — это полностью транс-нонапренилдифосфат, 1-4-дигидрокси-2-нафтоат и ион водорода, а три продукта — это деметилменахинол-9, дифосфат и диоксид углерода. Однако другие субстраты, которые может использовать этот фермент, включают фарнезилдифосфат или соланезилдифосфат вместо полностью транс-нонапренилдифосфата. [1]
1-4-дигидрокси-2-нафтоат полипренилтрансфераза расположена на 88-й минуте хромосомы E. coli , тогда как остальные гены, отвечающие за синтез менахинона (витамина К), сгруппированы на 51-й минуте. [2]
Этот фермент принадлежит к семейству трансфераз , которые в частности переносят алкильные или арильные группы, отличные от метильных групп. [3] Другие названия фермента включают 1-4-дигидрокси-2-нафтоат октапренилтрансферазу, 1-4-дигидрокси-2-нафтоат монопренилтрансферазу и MenA. [1]
Функция
1-4-дигидрокси-2-нафтоат полипренилтрансфераза является 8-м из 9 этапов биосинтеза менахинона (витамина К), в частности деметилменахинола-9 в E. coli . Витамин К является кофактором, жизненно важным для жизни, и функционирует как переносчик одного электрона в фотосинтезе в качестве окислительно-восстановительной молекулы. [4] Реакции, катализируемые этим ферментом, работают путем взятия растворимого бициклического нафталиноидного соединения DHNA и преобразования его в деметилменахинон-9 путем присоединения боковой цепи из 40 атомов углерода к DHNA. Однако этот фермент уникален в том смысле, что он может добавлять боковые цепи углерода разной длины к DHNA для получения различных деметилменахинолов и менахинолов. [2]
Другие организмы, которые содержат этот путь, включают Micrococcus luterus и Mycobacterium tuberculosis . [1]
Ингибиторы и активаторы
Для работы E. coli и Micrococcus luterus требуется Mg 2+ , а оптимальным для Micrococcus luterus является pH 7. ЭДТА также является активирующим соединением для фермента в Micrococcus luterus при оптимальной концентрации 5 мМ, но как только он достигает 20 мМ, он становится ингибитором, и для его реактивации требуется Mg 2+ .
| Ингибиторы ферментов | Организм |
|---|---|
| (R)-1-(4-((3-((4-хлорфенил)(метоксиимино)метил)фенокси)-метил)пиперидин-1-ил)октан-2-ил карбамат | Микобактерии туберкулеза |
| (R)-1-(4-((3-(4-хлорбензоил)фенокси)метил)пиперидин-1-ил)-октан-2-ил карбамат | Микобактерии туберкулеза |
| (S)-(2-хлор-4-((1-(2-гидроксиоктил)пиперидин-4-ил)метокси)-фенил)(4-хлорфенил)метанон | Микобактерии туберкулеза |
| (S)-1-(4-((3-хлор-4-((4-хлорфенил)(метоксиимино)метил)-фенокси)метил)пиперидин-1-ил)октан-2-ил карбамат | Микобактерии туберкулеза |
| (S)-1-(4-((3-хлор-4-(4-хлорбензоил)фенокси)метил)-пиперидин-1-ил)октан-2-ил карбамат | Микобактерии туберкулеза |
| Са 2+ | Микрококк лютерус |
| ЭДТА | Микрококк лютерус |
Расположение
Расположение 1-4-дигидрокси-2-нафтоатполипренилтрансферазы находится внутри мембраны. [1]
Ссылки
- ^ abcd "Информация о EC 2.5.1.74 - 1,4-дигидрокси-2-нафтоат полипренилтрансфераза". База данных BRENDA . 2014. Получено 23 декабря 2014 г.
- ^ ab Suvarna K, Stevenson D, Meganathan R, Hudspeth ME (май 1998). "Биосинтез менахинона (витамина K2): локализация и характеристика гена menA из Escherichia coli". Journal of Bacteriology . 180 (10): 2782–7. doi :10.1128/jb.180.10.2782-2787.1998. PMC 107237 . PMID 9573170.
- ^ "Список ферментов, класс 2 — Трансферазы". ExplorEnz: База данных ферментов . 2014. Получено 23 декабря 2014 .
- ^ ван Остенде С., Видхальм младший, Фурт Ф., Дюклюзо А.Л., Бассет Г.Дж. (2011). Ребей Ф., Дус Р. (ред.). «Филлохинон (витамин К1): функция, ферменты и гены». Достижения ботанических исследований (59). Амстердам: Академическая пресса: 229–61.
