(S)-2-гидроксикислотная оксидаза
| (S)-2-гидроксикислотная оксидаза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Тетрамер гликолатоксидазы, Человек | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 1.1.3.15 | ||||||||
| Номер CAS | 9037-63-2 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| ИнтЭнз | IntEnz вид | ||||||||
| БРЕНДА | запись BRENDA | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme вид | ||||||||
| КЕГГ | запись KEGG | ||||||||
| МетаЦик | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
В энзимологии оксидаза (S)-2-гидроксикислот ( EC 1.1.3.15) — это фермент , катализирующий химическую реакцию
- (S)-2-гидроксикислота + O 2 2-оксокислота + H 2 O 2
Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются (S)-2-гидроксикислота и O 2 , тогда как двумя его продуктами являются 2-оксокислота и H 2 O 2 .
Этот фермент принадлежит к семейству оксидоредуктаз , в частности, тех, которые действуют на группу CH-OH донора с кислородом в качестве акцептора. Систематическое название этого класса ферментов - (S)-2-гидроксикислота: кислород 2-оксидоредуктаза . Другие общеупотребительные названия включают гликолатоксидазу , гидроксикислотную оксидазу A , гидроксикислотную оксидазу B , оксидазу, L-2-гидроксикислоту , гидроксикислотную оксидазу A , L-альфа-гидроксикислотную оксидазу и L-2-гидроксикислотную оксидазу . Этот фермент участвует в метаболизме глиоксилата и дикарбоксилата . Он использует один кофактор , FMN .
Структурные исследования
По состоянию на конец 2007 года для этого класса ферментов было решено 5 структур с кодами доступа PDB 1AL7, 1AL8, 1GYL, 1TB3 и 2NZL.
Ссылки
- Blanchard M, Green DE, Nocito-Carroll V, Ratner S (1946). "Оксидаза l-гидроксикислоты" (PDF) . J. Biol. Chem . 163 (1): 137–144. doi : 10.1016/S0021-9258(17)41353-6 . PMID 21023634.
- FRIGERIO NA, HARBURY HA (1958). «Получение и некоторые свойства кристаллической гликолевой оксидазы шпината». J. Biol. Chem . 231 (1): 135–57. doi : 10.1016/S0021-9258(19)77292-5 . PMID 13538955.
- KUN E, DECHARY JM, PITOT HC (1954). «Окисление гликолевой кислоты ферментом печени». J. Biol. Chem . 210 (1): 269–80. doi : 10.1016/S0021-9258(18)65451-1 . PMID 13201588.
- Nakano M, Danowski TS (1966). «Кристаллическая оксидаза L-аминокислот млекопитающих из митохондрий почек крыс». J. Biol. Chem . 241 (9): 2075–83. doi : 10.1016/S0021-9258(18)96668-8 . PMID 5946631.
- Nakano M, Ushijima Y, Saga M, Tsutsumi Y, Asami H (1968). «Алифатическая оксидаза L-альфа-гидроксикислот из печени крыс: очистка и свойства». Biochim. Biophys. Acta . 167 (1): 9–22. doi :10.1016/0005-2744(68)90273-8. PMID 5686300.
- Шуман М., Мэсси В. (1971). «Очистка и характеристика оксидазы гликолевой кислоты из печени свиньи» (PDF) . Biochim. Biophys. Acta . 227 (3): 500–20. doi :10.1016/0005-2744(71)90003-9. hdl : 2027.42/33685 . PMID 5569122.
- Phillips DR, Duley JA, Fennell DJ, Holmes RS (1976). «Самоассоциация оксидазы L-альфа-гидроксикислоты». Biochim. Biophys. Acta . 427 (2): 679–87. doi :10.1016/0005-2795(76)90211-7. PMID 1268224.
- Rembeza E, Engqvist MK (2021). «Экспериментальное и вычислительное исследование функциональных аннотаций ферментов раскрывает неправильную аннотацию в классе ферментов EC 1.1.3.15». PLOS Comput Biol . 17 (9): e1009446. Bibcode : 2021PLSCB..17E9446R. doi : 10.1371/journal.pcbi.1009446 . PMC 8491902. PMID 34555022 .
